當(dāng)采用處理流程時，醫(yī)院污水應(yīng)與職工生活區(qū)污水、雨水分流，僅對醫(yī)院污水進(jìn)行消毒處理；當(dāng)采用二級或深度處理流程時，根據(jù)需要，職工生活區(qū)污水可與醫(yī)院污水河流進(jìn)行處理，但廚房用水設(shè)隔油井（池）。醫(yī)療污水處理設(shè)備根據(jù)醫(yī)院污水的特點，一般采用成熟的“厭氧水解+生物接觸氧化+消毒”的工藝。

現(xiàn)代污水處理技術(shù)，按處理程度劃分，可分為、二級和三級處理，一般根據(jù)水質(zhì)狀況和處理后的水的去向來確定污水處理程度。 處理主要去除污水中呈懸浮狀態(tài)的固體污染物質(zhì)，物理處理法大部分只能完成處理的要求。經(jīng)過處理的污水，BOD一般可去除30%左右，達(dá)不到排放標(biāo)準(zhǔn)。處理屬于二級處理的預(yù)處理。 二級處理主要去除污水中呈膠體和溶解狀態(tài)的有機(jī)污染物質(zhì)（BOD，COD物質(zhì)），去除率可達(dá)90%以上，使有機(jī)污染物達(dá)到排放標(biāo)準(zhǔn)，懸浮物去除率達(dá)95%出水效果好。 三級處理進(jìn)一步處理難降解的有機(jī)物、氮和磷等能夠?qū)е滤w富營養(yǎng)化的可溶性無機(jī)物等。主要方法有生物脫氮除磷法，混凝沉淀法，砂濾法，活性炭吸附法，離子交換法和電滲析法等。

整個過程為通過粗格柵的原污水經(jīng)過污水提升泵提升后，經(jīng)過格柵或者篩率器，之后進(jìn)入沉砂池，經(jīng)過砂水分離的污水進(jìn)入初次沉淀池，以上為處理（即物理處理），初沉池的出水進(jìn)入生物處理設(shè)備，有活性污泥法和生物膜法，（其中活性污泥法的反應(yīng)器有曝氣池，氧化溝等，生物膜法包括生物濾池、生物轉(zhuǎn)盤、生物接觸氧化法和生物流化床），生物處理設(shè)備的出水進(jìn)入二次沉淀池，二沉池的出水經(jīng)過消毒排放或者進(jìn)入三級處理，處理結(jié)束到此為二級處理，三級處理包括生物脫氮除磷法，混凝沉淀法，砂濾法，活性炭吸附法，離子交換法和電滲析法。二沉池的污泥一部分回流至初次沉淀池或者生物處理設(shè)備，一部分進(jìn)入污泥濃縮池，之后進(jìn)入污泥消化池，經(jīng)過脫水和干燥設(shè)備后，污泥被后利用。